Manipuler les microbiomes des plantes pour soutenir les fonctions des écosystèmes terrestres

Description du projet

#Microbiome #Génomique #Écologie microbienne
Les microbes colonisent les tissus de la rhizosphère (racines) et de la phyllosphère (parties aériennes, principalement les feuilles) des plantes, créant ainsi un axe de signalisation bidirectionnel entre les racines et les pousses. Il s'agit d'un système de communication bidirectionnel complexe dans lequel les racines et les pousses échangent des ressources, mais aussi des informations pour s'adapter aux conditions environnementales changeantes et coordonner leurs stratégies de croissance et de défense. Les interactions plantes-microbes influencent la productivité et la survie des plantes face aux changements globaux, mais leur capacité d'adaptation peut dépendre de la capacité du microbiote associé à l'hôte à répondre rapidement aux nouvelles conditions.
Ce projet vise donc à manipuler les microbiomes des racines et des feuilles afin d'augmenter la croissance et la résistance des plantes hôtes en cas de stress.
Notre groupe cherche à pourvoir différents postes aux niveaux MSc, PhD et postdoc pour lancer cette initiative. Mon laboratoire, qui compte entre 10 et 15 personnes en recherche, travaille sur les microbiomes végétaux et humains et sur la manière dont ils peuvent influencer leur hôte, mais aussi, à plus grande échelle, les fonctions de l'écosystème. Les membres de mon laboratoire acquièrent des compétences dans tous les domaines, notamment en bio-informatique et en biostatistique pour traiter les données génomiques, les expériences de croissance des plantes, les compétences de laboratoire en microbiologie et en biologie moléculaire, ainsi que la communication scientifique et la vulgarisation.
Les objectifs spécifiques de ce projet sont de concevoir des communautés synthétiques racinaires et foliaires minimales favorisant la croissance des plantes (SynComs) à partir de collections de cultures d'Arabidopsis thaliana (OBJ1); d'évaluer l'influence du potentiel métabolique et des effets de priorité sur l'établissement et la persistance des souches bactériennes (compétence de colonisation) (OBJ2); mesurer les impacts de la manipulation d'un compartiment, des deux et d'aucun compartiment sur la croissance de la plante hôte et sa résilience aux stress abiotiques et biotiques en utilisant Arabidopsis thaliana et Brassica napus (OBJ3); et enfin développer un modèle mathématique basé sur les théories écologiques pour étudier les interactions microbes-microbes et généraliser nos résultats à d'autres écosystèmes (OBJ4).
Les différents objectifs de ce projet nous permettent de recruter une équipe diversifiée de personnes étudiantes et de chercheur.e.s qui travailleront ensemble pour atteindre les objectifs du projet.
Rejoignez un laboratoire dynamique et diversifié!
N'hésitez pas à me contacter si vous avez des questions.

Financement offert

Oui

La dernière mise à jour a été faite le 1 novembre 2024. L’Université se réserve le droit de modifier ses projets sans préavis.