Étude de la régulation de synthèse et d’activité des protéines alternatives

Selon le dogme de la synthèse protéique, les ribosomes produisent une seule protéine pour chaque ARNm mature, appelée protéine de référence, et les ARN annotés comme non codants (lncRNAs, pseudogenes RNAs) ne contiennent pas de séquences codantes. Les séquences codantes sont annotées dans des bases de données comme RefSeq, et les protéines de référence sont annotées dans des bases de données comme UniProt. L’équipe de recherche du Pr Xavier Roucou a plutôt observé que les ARNm contiennent plus qu’une seule séquence codante et qu’elles peuvent être traduites, et que de nombreux ARN annotés comme non-codants sont en fait des ARN codants.

Les projets d’étude du laboratoire Roucou consistent à utiliser des approches protéomiques et bioinformatiques pour déterminer le mécanisme de régulation de synthèse et l’activité de ces protéines alternatives passées jusqu’ici complètement inaperçues. Des portes de maîtrise et de doctorat, pouvant se concentrer sur des aspects bioinformatiques, expérimentaux, ou combiner les deux domaines, sont disponibles. Les pathologies qui intéressent le laboratoire sont le cancer et les maladies neurodégénératives.Nous appelons ces nouvelles séquences codantes et nouvelles protéines des séquences codantes alternatives et des protéines alternatives. Un grand nombre de ces nouvelles protéines sont conservées à travers l’évolution. Ainsi, des milliers de gènes seraient potentiellement multicodants.