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Jean-Baptiste Michaud

Professeur, Faculté de génie
FAC. GÉNIE Électrique et informatique

Présentation

Sujet de recherche

Imagerie, Systèmes neuronaux, Modélisation et simulation, Interactions rayonnement-matière, Algorithmes, Technologies des soins

Disciplines de recherche

Génie électrique et génie électronique, Génie biomédical et génie biochimique

Mots-clés

Intelligence artificielle, Médecine de précision/Vasopresseurs, Traitement des signaux et des données, Élastographie/Cancer du sein, Instrumentation biomédicale, Modélisation/personnalisation temps réel, Apprentissage profond, Imagerie moléculaire/Tomographie d'émission par po, Réseaux de neurones

Intérêts de recherche

1) Intelligence artificielle et apprentissage machine en santé : Amélioration de la trajectoire de soins; en particulier, boucle fermée pour le contrôle de la pression artérielle par apprentissage profond des données populationnelles; aspects sociaux (intégration à la pratique médicale), réglementaires (déontologie) et épistémologiques de l’IA en santé 2) Intelligence artificielle et apprentissage machine en instrumentation de l’imagerie médicale : Reconstruction d’images, correction de mouvement, modélisation du système, recouvrement de sensibilité et configuration automatique 3) Instrumentation biomédicale : Systèmes électroniques et logiciels pour applications cliniques 4) Algorithmes avancés, traitement du signal et des données : Filtrage, identification paramétrique, optimisation, décisions 5) Architecture des systèmes complexes : Intégration matérielle, logicielle et micrologicielle, flot de données temps réel des appareils connectés, configuration automatique évolutive

Langues parlées et écrites

Anglais, Français

Diplômes

(2014). Efficacité de détection en tomographie d'émission par positrons: une approche par intelligence artificielle ? (Doctorat, Ph.D.). Université de Sherbrooke.

(2005). Identification paramétrique et quantification vectorielle appliquée à la tomographie d’émission par positrons (Maîtrise avec mémoire, M.Sc.A.). Université de Sherbrooke.

(1998). (Baccalauréat, B.Ing.). Université de Sherbrooke.

Expérience académique

Professeur en génie électrique. (2024-). Université de Sherbrooke. Canada.

Professeur associé. (2014-2023). Université de Sherbrooke. Canada.

Prix et distinctions

  • (1998) Bourse Canada. Gouvernement du Canada. (Distinction).
  • Médaille du Gouverneur général du Canada. Gouvernement du Canada. (Distinction).
  • Médaille du Gouverneur général du Canada. Gouvernement du Canada. (Distinction).
  • Prix du mérite Jacques-Bazinet pour la qualité de l'enseignement - Génie informatique. Université de Sherbrooke. (Distinction).
  • Prix du mérite Jacques-Bazinet pour la qualité de l'enseignement - Génie électrique. Université de Sherbrooke. (Distinction).
  • Prix du mérite Jacques-Bazinet pour la qualité de l'enseignement - Génie électrique. Université de Sherbrooke. (Distinction).
  • Student Paper Award. IEEE Medical Imaging Conference. (Distinction).
  • Student Paper Award. IEEE Medical Imaging Conference. (Distinction).

Financement

  • Subvention. (Obtenu). Cochercheur. Automating a bra-based breast screening system via ML methods for personalized use. Breast Cancer Society of Canada. Breast Cancer Canada/AstraZeneca/Illumina Screening and Detection Research Grant. 100 000 $. (2023-2025)
  • Contrat. (Obtenu). Cochercheur. Développement d'une boucle fermée pour améliorer la sécurité des agents vasoactifs. TransfertTech Sherbrooke Inc.. Fonds propres. 18 750 $. (2023-2025)
  • Subvention. (Obtenu). Cochercheur. Automating data acquisition and data processing pipeline via AI and ML approaches to allow at-home use of a novel breast cancer screening method employing bra-based elastography imaging. Instituts de Recherche en Santé du Canada (IRSC). NWHRI Innovation Fund – Biomed Discovery Grants. 150 000 $. (2024-2025)
  • Subvention. (Obtenu). Chercheur principal. Conception de nouveaux scanners, nouvelles technologies et nouveaux algorithmes en imagerie médicale. Calcul Canada. Subvention pour les groupes de recherche. 44 000 $. (2024-2025)
  • Subvention. (Terminé). Chercheur principal. Conception de nouveaux scanners, nouvelles technologies et nouveaux algorithmes en imagerie médicale. Calcul Canada. Research Group Allocation. 26 000 $. (2023-2024)
  • Subvention. (Terminé). Chercheur principal. Conception de nouveaux scanners, nouvelles technologies et nouveaux algorithmes en imagerie médicale. Calcul Canada. Research Group Allocation. 35 000 $. (2022-2023)
  • Subvention. (Terminé). Chercheur principal. Subvention à la découverte individuelle. Conseil de Recherches en Sciences Naturelles et Génie du Canada (CRSNG). Subvention à la décourverte individuelle. 217 000 $. (2016-2023)
  • Subvention. (Terminé). Cochercheur. Personnalisation et gestion automatique sécurisée de l’administration de vasopresseurs aux soins intensifs: modélisation pour le contrôle en boucle fermée. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Projets structurants. 75 000 $. (2020-2022)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Principes fondamentaux, reconstruction d'image et apprentissage machine en imagerie médicale. Calcul Canada. Research Group Allocation. 48 875 $. (2021-2022)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Principes fondamentaux, reconstruction d'image et apprentissage machine en imagerie médicale. Calcul Canada. Research Group Allocation. 43 000 $. (2020-2021)
  • Subvention. (Terminé). Chercheur principal. Développement d’une boucle fermée pour améliorer la sécurité des agents vasoactifs. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Programme Aide & Financement Interne. 25 000 $. (2019-2020)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Principes fondamentaux, reconstruction d'image et apprentissage machine en imagerie médicale. Calcul Canada. Subvention aux groupes de recherche. 49 000 $. (2019-2020)
  • Subvention. (Terminé). Chercheur principal. Reconstruction d’images, apprentissage machine et développement de nouveaux scanners. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Aide aux nouveaux chercheurs. 12 500 $. (2019-2020)
  • Bourse d’études. (Terminé). Candidat principal. Sensitivity in Positron Emission Tomography: an AI approach. CRSNG & CRSH. BESC-D3. 105 000 $. (2005-2008)

Publications

Articles de revue

  • Geoffroy C*, Michaud J-B, Tétrault M-A*, Clerk-Lamalice J*, Brunet C-A, Lecomte R, Fontaine R. (2015). Real Time Artificial Neural Network FPGA Implementation for Triple Coincidences Recovery in PET. IEEE Transaction on Nuclear Science 62 (3), 824-831. (Article publié).
  • Michaud J-B, Tétrault M-A*, Beaudoin J-F, Cadorette J, Brunet C-A, Lecomte R, Fontaine R. (2015). Sensitivity Increase through a Neural Network Method for LOR Recovery of ICS Triple Coincidences in High-Resolution Pixelated-Detectors PET Scanners. IEEE Transactions on Nuclear Science 62 (1), 82-94. (Article publié).
  • Michaud J-B*, Pepin C*, Lecomte R, Fontaine R. (2010). ARMAX-RLS Parameter-Estimation Crystal Identification in phoswich PET Detectors. IEEE Transactions on Nuclear Science 57 (3), 982-989. (Article publié).
  • Fontaine R, Bélanger F*, Viscogliosi N*, Semmaoui H*, Tétrault M-A*, Michaud J-B*, Pepin C, Cadorette J, Lecomte R. (2009). The Hardware and Signal Processing Architecture of LabTEP™, a Small Animal APD-based Digital PET Scanner. IEEE Transactions on Nuclear Science 56 (1), 3-9. (Article publié).
  • Leroux J-D*, Tétrault M-A*, Rouleau D, Pepin C*, Michaud J-B*, Cadorette J, Fontaine R, Lecomte R. (2009). Time Discrimination Techniques using Artificial Neural Networks for Positron Emission Tomography. IEEE Transactions on Nuclear Science 56 (3), 588-595. (Article publié).

Articles de conférence

  • Michaud; Giroux*; Cenci*; Houle*, Toussaint*; Lecomte. (2023). 3D Deep-Learning Attenuation Map Generation from Uncorrected Brain PET Images. IEEE Nuclear Symposium and Medical Imaging Conference. (Article accepté).
  • Toussaint*; Beaudoin; Bouchard*; Galarneau; Auger; Michaud; Michaud; Tétrault; Lecomte. (2023). Creation of a Head Tracking Dataset for Motion Correction in High Resolution Brain PET Imaging. Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference. (Article accepté).
  • Loignon-Houle*; Toussaint*; Beaudoin; Gaudreault*; Doyon*; Leroux; Auger; Thibaudeau; Arpin; Croteau; Espinosa-Bentancourt; Samson*; Bouchard*; Espagnet; Viscogliosi; Pepin; Labrecque; Paulin; Marin; Ouyang; Normandin; Tétrault; Michaud; Fontaine; El Fakhri; Lecomte. (2023). Imaging Performance of the Fully Assembled Ultra-High Resolution (UHR) Brain PET scanner. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference. (Article accepté).
  • Lecomte; Thibaudeau; Auger; Arpin; Leroux; Beaudoin; Loignon-Houle*; Doyon; Croteau; Lavallée; Lauzier Trépanier; Gaudreault; Bouchard*; Espagnet; Samson*; Collin; Hachey; Dussault-Frenette; Dufour-Forget*; Koua; Lemay; Viscogliosi; Bouziri*; Pepin; Toussaint*; Labrecque; Grève; Paulin; Chemli; Marin; Normandin; Ouyang; Petibon; Michaud; Tétrault; El Fakhri; Fontaine. (2022). Initial Performance Characterization of the UHR Brain PET Scanner. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference. (Article publié).
  • Michaud; Buteau*; Thibaudeau; Arpin; Fontaine; Lecomte. (2022). Timewalk Correction for PET Scanners with Time-over-Threshold Signal Digitization. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference. (Article publié).
  • Buteau*; Fontaine; Michaud. (2020). Parallelizing Performance Characterization of a Dual-Threshold Time-over-Threshold APD-basedPET Detector. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference. (Article publié).
  • Fontaine; Arpin; Paulin; Koua; Bouziri*; Njejimana*; Thibaudeau; Beaudoin; Cadorette; Panier; Abidi; Bouchard*; Jurgensen*; Tetrault*; Bergeron*; Gaudin*; Loignon-Houle*; Charest; Paille; Samson*; Lauzier-Trepanier*; Ben Attouch, Rossignol*; Gaudreault; Forest; Viscogliosi; Berthelot; Pepin; Michaud; Brunet; Pratte; Lecomte. (2016). The Hardware Architecture of the LabPETII-Mouse, a Highly Integrated APD-Based PET Scanner. IEEE Nuclear Science Symposium / Medical Imaging Conference. (Article accepté).
  • Michaud J-B*, Brunet C-A, Lecomte R, Fontaine R. (2010). Results from neural networks for recovery of PET triple coincidences. 2010 IEEE Nuclear Science Symposium Conference Record (NSS/MIC), 3085-3087. (Article publié).
  • Michaud J-B*, Rechka S*, Brunet C-A, Lecomte R, Fontaine R. (2009). Monte-Carlo results from neural networks as an alternative to Compton photons LOR analysis. 2009 IEEE Nuclear Science Symposium Conference Record (NSS/MIC), 3909-3916. (Article publié).

Propriétés intellectuelles

Brevets

  • (2010). Digital identification and vector quantization methods for detector signal shape discrimination in radiation detection machines. 7791029. États-Unis d'Amérique. (Délivré).
  • Method and apparatus for identification of line-of-responses of multiple photons in radiation detection machines. 20120290519 A1. États-Unis d'Amérique. (Retiré).
  • Lamontagne; Michaud; Gervais; Camirand Lemyre. System for controlling an administration of infused substances. PCT WO 2022/232920 A1. Canada. (En instance).

Licences

  • Licence entre SOCPRA SSH s.e.c. (propriété de l'Université de Sherbrooke) et Northridge Trimodality Imaging – Canada Inc. (2013). (Licence obtenue).

Autres contributions

Présentations

  • Auger et al. (2023). NEMA Performance Characteristics of the UHR Brain PET Scanner. Society of Nuclear Medicine and Molecular Imaging Annual Meeting. États-Unis d'Amérique
  • R. Lecomte et al. (2022). Initial Performance Characterization of the UHR Brain PET Scanner. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference. Milan, Italie
  • J.-B. Michaud, P. Buteau, C. Thibaudeau, L. Arpin, R. Fontaine, R. Lecomte. (2022). Timewalk Correction for PET Scanners with Time-over-Threshold Signal Digitization. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference. Milan, Italie
  • P. Buteau, R. Fontaine et J.-B. Michaud. (2020). Parallelizing Performance Characterization of a Dual-Threshold Time-over-Threshold APD-based PET Detector. Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Confernece. Boston, États-Unis d'Amérique
  • Fontaine et al. (2016). The Hardware Architecture of the LabPET II-Mouse, a Highly Integrated APD-Based PET Scanner. Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference. Strasbourg, France
  • Michaud J-B*, Brunet C-A, Lecomte R, Fontaine R. (2010). Results from neural networks for recovery of PET triple coincidences. IEEE Medical Imaging Conference. Knoxville, États-Unis d'Amérique
  • Michaud*. (2010). Sensitivity in High-Resolution PET: a Neural Network Alternative for Multiple Coincidences Recovery. Brookhaven National Laboratory (BNL) Medical Department Seminars. Upton, États-Unis d'Amérique
  • Michaud*. (2009). Sensitivity in PET: alternative method for Compton-scatter discrimination based on neural networks. Séminaires de professeurs invités de l'Instituto de Fisica Corpuscular, Universitat de Valencia. Valencia, Espagne
  • Michaud*. (2005). Advanced Digital Signal Processing in PET: Timestamp & DOI. IEEE NPSS Brookhaven National Laboratory (BNL) Instrumentation Seminars. États-Unis d'Amérique