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Bio-informatique

La plateforme de bio-informatique dirigée par Mariano Avino, PhD, offre une variété de services d’analyses standardisés et personnalisés aux chercheurs pour l’analyse et la visualisation de données issues de la génomique, de la trancriptomique et de la protéomique.

La plateforme travaille au développement de solutions originales dans le traitement des données à large échelle nécessitant des techniques de calcul et de programmation de pointe. L’équipe responsable de la plateforme peut aussi fournir une formation bio-informatique de base permettant de réaliser certains projets de recherche. Enfin, elle peut fournir du soutien pour la visualisation de données à large échelle.

Service offerts

  • Assemblages de séquences
  • Annotation des génomes
  • Oncogénomique
  • Expression génétique (RNA-seq, Chip-seq, analyses de données de cellules uniques)
  • Séquençage d’ADN
  • Protéomique et Protéogénomique
  • Biologie des réseaux et des systèmes
  • Génétique des populations
  • Analyses phylogénétiques
  • Génomique comparative (e.g. microbiome)
  • Bases de données
  • Analyses statistiques et modélisations mathématiques
  • Bio-informatique structurale

Équipe

Pr Xavier Roucou

Pr Xavier Roucou, PhD

Gestionnaire

Pre Michelle Scott

Pre Michelle Scott, PhD

Responsable scientifique

Mariano Avino

Mariano Avino, PhD

Directeur des opérations

Informations supplémentaires

  • Académique Université de Sherbrooke : 40$
  • Académique externe : 100$
  • Industrie : 140$